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农作物论文_基于纤毛鹅观草特异的卫星重复序列

来源:天然产物研究与开发 【在线投稿】 栏目:期刊导读 时间:2022-01-26 11:32
作者:网站采编
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摘要:文章摘要:【目的】开发纤毛鹅观草特异的寡核苷酸(oligonucleotide,oligo)探针,进一步完善纤毛鹅观草染色体鉴定技术。【方法】利用前期选育的普通小麦-纤毛鹅观草异附加系DA2S c L和

文章摘要:【目的】开发纤毛鹅观草特异的寡核苷酸(oligonucleotide,oligo)探针,进一步完善纤毛鹅观草染色体鉴定技术。【方法】利用前期选育的普通小麦-纤毛鹅观草异附加系DA2ScL和DA6Sc,通过流式分拣和基因组二代测序获得纤毛鹅观草染色体6Sc和染色体臂2Sc长臂的基因组序列,利用Reapeatexplorer2/TAREAN软件从中鉴定出卫星重复序列并设计成oligo探针,通过荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)分析所开发oligo探针的应用价值。【结果】本研究从6Sc和2ScL 基因组序列中共鉴定出11个卫星重复序列并开发成11个oligo探针,oligo-FISH结果表明,其中6个探针可以在纤毛鹅观草染色体上产生明显杂交信号,而在小麦染色体上未产生明显杂交信号,可用于特异鉴定小麦背景中的纤毛鹅观草染色体或片段;对一套普通小麦-纤毛鹅观草异附加系oligo-FISH分析发现,oligo-2ScL-163和oligo-6Sc-111仅在Sc基因组染色体上产生明显信号,可作为纤毛鹅观草Sc组特异探针;将oligo-2ScL-161和oligo-2ScL-163组合,对一整套二体异附加系进行双色oligo-FISH,构建了纤毛鹅观草染色体的oligo-FISH核型。【结论】本研究首次提供了纤毛鹅观草重复序列组成的初步信息,开发的探针对于特异鉴定纤毛鹅观草染色体、阐明纤毛鹅观草两个基因组的来源和分化、推动纤毛鹅观草优异基因的转移和利用有重要意义。

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项目基金:《天然产物研究与开发》 网址: http://www.trcwyjykfzz.cn/qikandaodu/2022/0126/1314.html



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