园艺论文_基于重测序的长豇豆基因组InDel标记-天然产物研究与开发

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园艺论文_基于重测序的长豇豆基因组InDel标记

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文章摘要:选取3份长豇豆种质资源进行全基因组重测序，利用重测序数据挖掘InDel位点，根据这些位点开发分子标记，并验证这些标记的有效性和应用价值。经过严格筛选，获得981个易于凝胶电泳检测的长度大于30bp且多态性高的InDel位点，挑选其中在基因组上均匀分布的165个设计引物并进行验证。用6份长豇豆材料对165对引物进行初筛，其中162对可获得PCR扩增产物，共扩增出673条带；85对引物表现出多态性，多态性带333条（占总带数的49.48%）。利用85个多态性高的标记对173份长豇豆资源进行基因分型和遗传多样性分析，共检测到333个等位位点；多态性信息含量（PIC）为0.01～0.37，平均值为0.29；基因多样性指数（Hs）变异范围为0.01～0.50，平均值为0.36，表明现有长豇豆资源遗传背景相对狭窄。通过聚类分析，173份豇豆被分为2个类群，成功将不同类型长豇豆划分到不同亚群。另外，选用亲本间多态性标记用于6个杂交组合的F₁代真实性鉴定，鉴定出5个真实杂交种。本研究所开发的多态性InDel 标记在长豇豆遗传多样性分析、杂交种纯度鉴定、遗传连锁图谱构建、基因定位和分子标记辅助选择育种等方面具有很好的应用前景。

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项目基金:《天然产物研究与开发》网址: http://www.trcwyjykfzz.cn/qikandaodu/2022/0120/1302.html